Os Departamentos Académicos são unidades científicas das Faculdades que de forma organizada e hierárquica englobam um conjunto de áreas científicas afins, capazes de oferecer docência, desenvolver a investigação e extensão e de realizar a gestão dos recursos colocados à sua disposição. 

Os Departamentos Académicos da Faculdade de Economia são: 

Departamento de Economia; 

Departamento de Gestão; 

Departamento de Contabilidade e Finanças; 

Departamento de Ensino a Distância; 

Departamento de Qualidade Académica; e

Departamento de Tecnologias de Informação, Comunicação e Biblioteca;